两眼视力差距过大也可以做飞秒手术，但是需要注意的是，需要眼睛的角膜条件符合手术要求，才可以接受飞秒手术治疗。
一般在飞秒手术之前需要完善验光、角膜地形图、角膜曲率、眼压、眼底疾病排查、角膜厚度、干眼分析等相关检查以排除角膜疾病、青光眼或眼底疾病患者。
如果术前相关检查符合手术要求，可以根据具体双眼数据进行手术设计以提高双眼术后裸眼视力。部分患者术前检查时干眼症状明显，则需要先给予人工泪液眼药水进行治疗，待角膜状态恢复择期行飞秒手术治疗。