手足口病和疱疹是不一样的，两者都是病毒性疾病，但是感染的病毒类型是不一样的。
手足口病是由肠道病毒引起的传染性疾病，好发于儿童，以3岁以下年龄组发病率最高。疱疹大多是由疱疹病毒感染引起的，会出现在各个年龄段中。手足口病的临床表现为发热、口腔和四肢末端的斑丘疹，疱疹重者会出现脑膜炎、脑炎、脑脊髓炎、肺水肿和循环障碍等。
疱疹由人疱疹病毒感染所致，疱疹病毒是一种DNA病毒，与人感染相关的疱疹病毒为人疱疹病毒，目前已知的有8种，较常见的有单纯疱疹病毒1型和2型、水痘-带状疱疹病毒，这些病毒分别引起口唇疱疹、水痘、带状疱疹等。