​​急性肾盂肾炎要和多种疾病相鉴别。急性肾盂肾炎和急性膀胱炎都会有尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状，但是和​​急性肾盂肾炎比，急性膀胱炎的患者一般没有腰痛，也没有发热等全身表现。
肾盂肾炎还要和急性尿道综合征鉴别。尿道综合征主要表现是无菌尿，也有尿路刺激征，但是程度一般较轻，多次尿细菌培养都是阴性，尿道综合征引起的尿频主要出现在白天，夜间排尿次数无明显增加。
再就是急性肾盂肾炎要和肾皮质化脓感染、与肾周围炎相鉴别。肾皮质化脓感染和肾周围炎都有全身症状和肾区胀痛或者是肿胀，但是没有明显的膀胱刺激症状。如果患者有肾盂肾炎，一定要及早就诊。