输精管堵塞主要的危害就是影响到男性的生育能力。因为输精管是精子排出的通道，当输精管堵塞以后，精子就无法完全排出，从而导致男性失去生育能力。
因此，在出现输精管堵塞的情况后，应尽早地进行治疗，恢复男性的生育能力。如果输精管堵塞为感染疾病所引起，比如输精管炎，在确诊以后主要是进行抗感染治疗，治疗周期大概为2~3周左右。
如果输精管内出现了囊肿，也会导致输精管堵塞。在必要时应进行微创手术治疗，将囊肿进行切除，输精管就会逐渐通畅，男性的生育能力会重新恢复。