尿路感染引起尿液混浊的病因，是细菌等病原体刺激泌尿系统的粘膜，引起泌尿系统粘膜坏死、脱落，脱落的组织混合在尿液中，看起来尿液会显得浑浊。
炎症刺激泌尿系统的粘膜会使粘膜下的血管扩张充血，血管内的血液会有大量的炎性物质渗出，同时血管内的白细胞聚集，它会吞噬坏死组织以及病原体而形成脓细胞。
坏死脱落的组织与渗出物、脓细胞，会形成大量的絮状物，这些絮状物混合在尿液中，会使尿液相当浑浊。