在临床上脑血吸虫病分为两种类型，分别是急性和慢性，大多数见于比较年轻的患者。
急性的脑型血吸虫病，大概在感染半年左右发病。患者常出现的临床症状主要包括腱反射亢进、发热、瘫痪、意识障碍、锥体束征、脑膜刺激症等。实验室检查可见脑积液正常，或者白细胞与蛋白轻度的增高，当病情得到控制、体温下降时，症状可以得到改善。
而慢性的脑血吸虫病的患者，主要的临床症状为局限性癫痫。还有一些患者会出现颅内压增高的情况，虫卵还会导致患者出现脑动脉栓塞的情况，因此会出现失语和偏瘫的症状。