做支气管纤维镜虽然有一定的危险，但其危险性并不是很大，要视具体情况来定。
通常做支气管镜是有一定的适应证和禁忌证，对于那些病情危重、心肺功能衰竭、生命体征不平稳患者，是不宜做支气管镜。当然，做支气管镜时，患者是有明显的不适感，例如咽喉部刺激出现呛咳、恶心、喘闷，甚至出现呼吸困难等现象。
对于既往有慢性心肺疾病以及老年患者，是有可能出现心律失常，少数患者甚至因此诱发心绞痛、心肌梗塞，偶有心脏骤停的危险。此外，在做支气管镜时，部分人员有可能出现气道内的出血，而产生一定的危险。故在做支气管镜时，要对检查者做好安全性的评估，并做好术前准备工作，尽量降低上述的危险和并发症等情况。
总之，支气管镜检查是安全有效的检查项目之一。