先天性卵巢发育不全，一般怀孕的概率比较小。因为卵巢发育不全就会影响卵巢正常的内分泌功能，引起卵巢分泌的雌激素和孕激素不足，从而影响卵泡发育。
如果卵泡不能发育成熟，排出卵子，就不能够自然怀孕。但是，某些先天性卵巢发育不全的患者，偶尔有可能会有排卵现象，所以也不排除有怀孕的可能，但是怀孕的概率比较小。
而且，先天性卵巢发育不全的女性一般不能够通过后天治疗的手段使卵巢功能发育正常。所以，如果某些女性被确诊患有先天性卵巢发育不全引起不孕不育后，可以采取试管婴儿的方式怀孕。