尿道口下裂对生育功能可能会造成一定影响，特别是阴茎根型和会阴型尿道下裂，是不孕的常见病因之一。
由于严重的尿道下裂可能影响阴茎海绵体勃起，不能进入阴道完成性交。即使能够完成性交，由于尿道开口位置异常，射出的精液不能进入女方生殖道，双方的生殖细胞不能有效结合而导致不孕，龟头型尿道下裂对性功能以及生育功能不会造成影响。
由于该类型的尿道下裂可进入阴道完成性交，并且精液能够射入阴道内，双方精卵可有效结合，临床可不做任何治疗处理。