肛周脓肿在急性发作期可以选择消炎类的药膏进行涂抹局部，如红霉素软膏、百多邦软膏，这两种药膏可以消炎止痛。
肛周脓肿是属于肛周软组织和间隙出现细菌感染，所引起的化脓性疾病，局部会出现红肿、热痛。单纯涂抹药膏只能够缓解局部的疼痛，并不能够彻底治愈肛周脓肿。需要及时到医院肛肠科就诊，切开脓包排脓，清理脓腔里的炎性脓液，避免脓腔自行破溃后导致肛瘘形成。
手术后还要静脉点滴抗生素进行抗感染治疗，伤口定期消毒更换药物，并配合中药坐浴，促进伤口的愈合。