妇科疾病，不是都可以用甲硝唑治疗的。妇科疾病的种类有很多，如果是阴道的炎症，一般认为是滴虫性阴道炎和细菌性阴道炎，是采取甲硝唑治疗的。而其它的炎症包括外阴阴道假丝酵母菌病，也就是霉菌性阴道炎，它是由于真菌感染导致的，甲硝唑治疗是无效的。
而衣原体性阴道炎，也不采取甲硝唑治疗，而妇科的其他疾病像子宫肌瘤、子宫腺肌症。根据它们疾病的特点，都有各自的治疗的手段和措施，并不是所有的疾病妇科疾病，都是采取甲硝唑治疗。
甲硝唑是一种抗厌氧菌的药物，只能治疗厌氧菌感染，而如果是普通的细菌感染，还要采取广普抗生素进行治疗。