心脏脂肪瘤是心脏的良性肿瘤，用药物保守治疗是无法根治心脏脂肪瘤的。
只有外科手术治疗才可以根治心脏脂肪瘤，外科治疗心脏脂肪瘤的方法包括心包引流、心包开窗与肿物切除。心脏脂肪瘤特別是带蒂、基底部不宽的肿瘤应手术彻底切除，但如侵犯心脏瓣膜、冠状动脉、心室间隔或传导系统，切除上述组织能引起严重后果者，则只能部分切除。
患者术后应长期随诊，以排除再发或复发的可能。随诊除自我感觉症状和体征外，最主要为超声心动图检査。要求术后4年内每半年1次，4年后每年1次检查。