胚胎停止发育后，需要查明原因，为以后能够怀到正常胎儿做准备。
首先，是需要做胚胎自身的染色体的检查，因为胚胎停育，大多是因为胚胎自身的染色体突变而导致的。排除这个因素之后，也可以做夫妻双方的身体检查来帮助寻找原因，比如精液常规的检查，排除畸形精子。
夫妻双方的染色体检查，或者女性要检查病毒感染的项目，血糖、血脂、血栓前状态、免疫抗体等；另外，需要检查内分泌，了解是否有黄体功能不良，或者是否存在高泌乳素血症，或者有的女性需要做宫腔镜检查，排除宫腔黏连、子宫内膜炎等问题，因为这些都是有可能导致胚胎停育的。