在怀孕早期染色体因素是引起胚胎停育最常见的原因，大约能占所有胚胎停育原因的50%至60%。对于胚胎停育的患者，建议针对胚胎的染色体进行化验，以明确是否由于染色体异常引起的胚胎停育。
如果发现胚胎的染色体异常，这种情况应该仔细寻找胚胎染色体异常的来源。
第一种情况，应该仔细检查夫妻双方的染色体，根据夫妻的双方染色体结果与胚胎染色体的结果进行对比。
如果胚胎染色体异常与夫妻双方染色体异常有一致的地方，那就说明这种异常来源于夫妻双方。对于这种情况应该进行遗传咨询判断下一次怀孕是正常妊娠还是进行试管婴儿。
第二，如果夫妻双方染色体正常，但是胚胎的染色体异常。这种情况考虑是由于卵子或精子在产生的过程中染色体错误发生了分配，引起了胚胎染色体异常。对于这种情况属于偶然事件，一般不会反复多次发生。3个月到半年以后可以正常备孕。