冠状沟小米粒样疙瘩的治疗处理，需要结合诱发病因制定。
由于致病菌感染引起冠状沟部位炎性疙瘩，可口服头孢克肟药物抗炎治疗，局部可用复方黄柏洗液清洗。由于不洁性行为后发生的米粒样小疙瘩，需要结合醋酸白试验鉴别检查，明确人乳头瘤病毒感染引起的赘生物，需要激光烧灼或液氮冷冻治疗，同时还需要抗病毒药物治疗。
观察到冠状沟部位长时间存在的米粒样疙瘩，并且不伴随任何症状，要考虑是个体生理性变异导致的珍珠疹生长，可不需要做特殊治疗。