甲状腺减退通常需要终身服药，但也因它的病因有差异，不同原发病预后不尽相同，甲减病因主要分为原发性甲减和中枢性甲减，原发性甲减常见原因为抗甲状腺药物治疗过量引起，甲状腺术后甲减、放射性131I治疗后甲减及自身免疫性甲状腺炎等。
如果为药物性原因引起，在停药或减少药物剂量后就能恢复，若为其它原因所致，则需要终生服药，需要定期复查，不可自行随机停药。
中枢性甲减则较罕见，包括下丘脑性甲减和垂体性甲减，常见于下丘脑和垂体手术、肿瘤及垂体缺血坏死，需要根据原发病情况决定是否需要终生服药。