小孩发烧灌肠对身体的影响主要在于以下几个方面：
1.在灌肠的操作过程中，容易损伤到肠道黏膜或者肛门部位，从而引发疼痛感以及肠道功能紊乱，导致患儿出现腹痛、腹胀、腹泻等不适症状。
2.如果经常使用灌肠的方法进行降温，还容易导致肠道里面的菌群出现失调的症状，从而降低肠道的免疫功能，导致孩子容易出现肠道方面的疾病。
3.孩子发烧的时候不建议采用灌肠的方法进行治疗，主要是以保守观察、物理降温、药物降温等方法进行治疗。如果发烧较为严重，可以到医院进行肌注紧急降温。除非有必要，才能够在医生指导下进行灌肠。