临床上亚急性甲状腺炎和甲状腺结节的区别主要有以下几点：
第一，临床表现不同，亚急性甲状腺炎，患者表现为颈部疼痛，严重者可伴有发热、一过性甲亢症状。甲状腺结节大多为良性结节，可表现为囊实性结节或实性结节，一般无明显的临床症状。炎性结节可表现为颈部疼痛，患者可伴有发热。很少部分为恶性结节。
第二，临床处理不同，亚急性甲状腺炎需要在医生的指导下，给予完善相关的检查明确诊断，给予相应的对症消炎止疼治疗，必要时给予糖皮质激素治疗。
甲状腺结节需要根据结节的性质来进一步的临床处理，如果为良性结节，需要完善甲状腺功能检测，定期复查甲状腺超声即可。对于恶性结节需要在超声指导下细针穿刺细胞学检查明确结节的性质，来决定下一步的处理。