甲状腺疾病如何治疗取决于甲状腺疾病的种类。比如甲状腺功能亢进，需要给予抗甲亢的药物治疗。
甲状腺功能减退，需要给予补充左旋甲状腺素钠片，纠正甲状腺功能减退的症状；结节性甲状腺肿，如果没有症状不需要治疗；如果发现有气管压迫症状或者癌变的风险，需要手术治疗；甲状腺瘤如果比较小也不需要治疗。
如果一旦发现长大明显或者有压迫症状，也是需要手术治疗；甲状腺癌是必须要手术治疗的，术后需要常规服用左旋甲状腺素钠片，如果有淋巴结转移，还需要做碘131的放射治疗。
无论是哪一种甲状腺疾病，给予治疗后需要定期的复查甲状腺彩超和甲状腺功能，密切观察甲状腺的变化，以防复发。