心脏房间隔缺损的症状，要根据房间隔缺损的大小以及病情进展的情况而定。
轻度的房间隔缺损往往不会引起明显的症状，当房间隔缺损比较严重时，可以引起胸闷、心慌、乏力等症状。当病情进展导致出现肺动脉高压造成右心衰竭时，可以引起体循环的瘀血，导致颈静脉怒张、呼吸困难、下肢水肿、肝区疼痛、恶心、呕吐、纳差、腹胀等症状，严重的患者甚至可以引起腹水。
当房间隔缺损引起右向左分流时，还可以引起紫绀。房间隔缺损的患者查体可以在胸骨左缘第二、三肋间闻及心脏杂音。