房颤形成血栓是比较严重的。如果栓子脱落有可能栓塞身体重要器官，最常见的是出现脑栓塞。
房颤患者出现脑栓塞，有可能造成患者肢体运动和感觉功能障碍，最重者可以出现脑水肿，危及生命。如果治疗不及时，往往会形成脑栓塞后遗症，影响患者的终生。
房颤患者还有可能并发其它脏器的栓塞，造成器官坏死和功能减退，影响也是很严重的，如肺栓塞、肠系膜上动脉栓塞等。所以房颤患者如果出现了血栓，就要积极的抗凝治疗，可以应用华法林。