巧克力囊肿是不会引起排卵期出血的。
巧克力囊肿主要是因为具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢而引起。在来月经的时候，病灶出现出血的现象，天长日久就形成了囊肿，常常会伴有痛经、伴有不孕不育等临床病史，建议积极地手术给予治疗。排卵期出血是因为在排卵期的时候，体内的激素水平发生了变化。雌激素和孕激素的降低就使子宫内膜暂时地失去了雌、孕激素的支撑，所以会导致少量的阴道出血。并且绝大部分3~5天会自行干净，出血量往往远远少于月经量。
建议必要的时候可以用雌性激素给予治疗，并且也建议在排卵期出血期间，保持外阴局部清洁。