代谢综合征发病的中心环节是胰岛素抵抗。但它的三个主要环节就是肥胖胰岛素抵抗心血管病的多重代谢危险因素之间错综复杂互为因果的相互关系，提示我们预防代谢综合征应该采取综合的措施，以改善胰岛素抵抗的敏感性为基础，针对代谢综合征的各个部分分别进行预防，注意减轻体重以及全面防治心血管病多重代谢危险因素，防治代谢综合征的主要目标是预防临床心血管病和二型糖尿病，对于已有心血管病的则是预防心血管病的再发、病残以及降低患者的死亡率。
首先应该倡导健康的生活方式，包括合理的饮食、增加体力活动和加强体育锻炼、减轻体重以及戒烟、限酒是防治代谢综合征的基础，还有一些药物比如说罗格列酮和吡格列酮以及二甲双胍，可以明显的改善胰岛素的敏感性，还可以通过改善血糖、血脂、血凝以及血管的内皮细胞的功能，从而减轻患者的炎症反应等，发挥抗动脉粥样硬化的作用；这些都是对预防代谢综合征具有潜在的保护意义。但是对代谢综合征治疗，目前还存在一些争议肥胖症和胰岛素抵抗的发生是密切相关的，配合运动和平衡的低热量饮食，必要的时候可以启动减重的药物，比如说，奥利司他、西布曲朗，都可以使体重下降，从而可以使胰岛素的敏感性比起来增加，并能够改善血脂谱，从而降低相关的心血管疾病的危险因素。