手足口病手掌、脚掌、臀部皮疹具有不结痂、不疼痛、不瘙痒等特点。愈合后不留痕迹，也不会有色素沉着，不会有鳞屑和脱皮。
所以，当发现手足口病皮疹后期有脱皮现象时，要和其他疾病鉴别，比如川崎病、手足硬肿后期会出现脱皮，比如麻疹、皮疹愈合后会有类似脱皮的鳞屑。
但是某些合并维生素缺乏的孩子，尤其是维生素B以及维生素A缺乏时，可能会出现脱皮的现象。此时可以适当增加蔬菜、水果的进食量，或者直接药物补充维生素治疗。