肛瘘手术后，可以用稀释的高锰酸钾，进行肛门熏洗坐浴。高锰酸钾具有抗炎、杀菌的作用，对控制肛瘘创面感染有作用。
还可以用清热燥湿、去腐生肌作用的中草药坐浴，中草药有黄芩、黄柏、苦参、五倍子等。坐浴时先将温热水倒入盆中，加入药物，先用热气在肛门部熏。待水温适宜时，将臀部浸没于水中进行坐浴。
肛瘘手术后熏洗坐浴，具有温暖、舒适、清洁伤口的作用，对创面有消炎、消肿、减轻疼痛的治疗效果。