眼睛不舒服头痛的情况，主要和视疲劳、青光眼、炎症感染、内科疾病等情况相关，具体可分为以下几种：
1.长期熬夜可导致眼肌麻痹、眼睛疲劳、酸涩，严重时会有头晕、头痛的表现。
2.青光眼眼压过高，超过正常范围，尤其是闭角型青光眼，眼眶压力大，神经可能受损。会有强烈的头痛、眼痛、眼红、视力下降等症状。
3.眼睛有炎症感染，例如疱疹病毒性角膜炎，病毒侵犯三叉神经，病情发作时患者眼眶疼痛伴同侧头痛。
4.颅脑占位或神经性疾病，也可能影响眼睛并伴有头痛。