仓鼠携带的细菌和病毒是非常多的，如果长期接触的话，可能会得一些疾病，包括细菌感染和寄生虫感染，常见的寄生虫有弓形虫病，如果感染的话，可能会出现一些脏器的损害，严重的话可能会出现弓形虫脑病，另外如果感染一些普通细菌，特别是通过消化道感染了可能会出现急性肠炎。
临床表现最常见的就是腹痛、腹泻，严重的话可能会出现脱水、电解质紊乱。当然如果被咬伤的话，可能会出现局部的细菌感染，出现局部红肿疼痛或者流脓。