结肠镜检查是包括直肠的，结肠镜的检查，要从肛门口的位置进入，通过直肠、乙状结肠、降结肠、横结肠、升结肠到达回盲部，然后开始进行退镜的观察。
可以观察肠道内的黏膜组织是否有充血、水肿、糜烂等病理性的改变，观察肠道内是否有异常增生的息肉或者是肿瘤。另外，结肠镜检查在到达肛管直肠位置时，可以通过倒镜的状态观察有没有痔疮的情况。
另外，结肠镜在检查的过程当中，还可以进行病理组织学的采样，一般直肠镜检查之后，建议患者适当地休息，避免过早地活动。