巧克力囊肿最典型的症状就是引起我们女性出现严重的痛经现象。并且这种痛经，它是进行性加重的，很多女性有可能还得靠药物来缓解痛经。
此外，巧克力囊肿体积巨大的时候，它可以压迫正常的卵巢组织，影响卵巢排卵以及分泌激素的功能，导致我们女性出现月经周期的紊乱，月经量的改变，并且影响到女性正常的怀孕。有的女性巧克力囊肿发生微小的破裂，可以引起周围组织的纤维化粘连，导致出现慢性的盆腔痛，或者是肠梗阻的现象出现。