怀孕三个月时出现轻微的腰疼属于正常现象。
怀孕后孕妇的体重逐渐增加，肚子逐渐增大会增加腰部受力，并且怀孕后激素分泌增加，导致肌肉弹性比较差，所以，会产生腰疼的症状。怀孕以后要及时补充钙质，胎儿和孕妇都需要大量的钙，如果缺钙也会引起腰痛。如果腰疼得比较厉害，也要排除是否由于泌尿系统结石引起的。
腰疼并伴有腹痛和阴道出血时，一定要及时去医院就诊，考虑有流产的发生。一般的腰痛在休息后会有适当的缓解，孕妇要避免长时间地行走和站立。