最常见的脑血栓的病因，是动脉硬化和各种易患因素，造成血管狭窄，或者栓子脱落堵塞脑血管。最常见的脑血栓是由于各种原因，引起的脑动脉主干或分支管腔狭窄、闭塞和血栓形成，导致局部血流减少或供血中断，脑缺血、缺氧坏死，并出现局部神经症状和体征。
一般动脉粥样硬化是脑血栓，形成最常见和最基本的原因，常伴有高血压，由于缺乏运动、肥胖、吃脂肪、吸烟和饮酒，也会导致脑血栓形成。
血栓形成最常见的原因是动脉硬化，由于脑动脉硬化、管腔内膜粗糙、管腔变窄。