乙肝注射干扰素的疗程一般在48周左右，部分患者需要延长至72周，是根据患者的具体病情来决定的。
乙肝患者使用干扰素主要是抗病毒治疗，抗病毒治疗期间需要监测肝功能、乙肝五项指标定量、乙肝DNA等相关指标。根据这些指标的变化来评估抗病毒的疗效，以及抗病毒的疗程。
目前，大部分乙肝患者使用干扰素抗病毒治疗，可以使乙肝病毒持续下降，乙肝表面抗原的数值也会逐渐下降。但一小部分人群可能抗病毒疗效较差，需要及时停药，必要时可以换成口服抗病毒药物。