手术治疗痔疮可以出现副作用，如肛门出血、肛门坠胀不适。
痔疮的手术方式也分为内痔手术和外痔手术。内痔的手术多采用套扎法、硬化剂或者坏死剂注射法，其目的都是引起痔核缺血坏死而脱落。术后可能出现肛门坠胀感、肛门出血、排便不畅等，随着逐渐恢复症状都可以消失。
而外痔大多数采用外剥内扎术，都采用切除痔核和周围皮肤，很少涉及到括约肌的损伤，所以副作用较少。常见于创面出血和感染、排便疼痛等。及时创面换药和肛门坐浴，症状也可以消失。