房颤当然可以用药物治疗，但是药物治疗的目的，一是控制过快的房颤的心室率，如美托洛尔、比索洛尔、索他洛尔、胺碘酮、普罗帕酮、西地兰、地高辛等等。
另一方面需要加强抗凝抗血小板的治疗，稳定血栓斑块，尽量避免斑块的形成。需要服用的药物有阿司匹林或氯吡格雷、华法林或利伐沙班或达比加群酯，调脂的药包括他汀类和贝特类。
对于心率较慢的房颤患者又有心慌的症状，不能应用降低心率的药，可以口服中药制剂，如稳心颗粒、宁心宝、参松养心胶囊等等。