男性不育的病因不同，所服用的药物也不一样。
如果男性不育为精索静脉曲张疾病所导致，应当进行手术治疗，在手术后可口服抗氧化的药物进行治疗，比如辅酶Q10，还可口服麒麟丸、五子衍宗丸等药物，促进睾丸的生精。
如果是雄性激素分泌过低所导致的男性不育，通常需要口服促进雄性激素分泌的药物，比如十一酸睾酮。如果男性不育为前列腺炎、精囊炎等生殖系统炎症疾病所导致，主要是口服抗生多类的药物进行治疗，将感染控制住后，男性会逐渐的恢复生育能力。