淋巴囊肿和甲状腺囊肿的区别在于发生的部位是不一样的，产生的临床表现也是不一样的。
淋巴囊肿可以发生在有淋巴管的所有组织当中，可以发生在体表组织，也可以发生在内部组织，而且淋巴囊肿扩张的程度是不一样的。如果淋巴囊肿扩张比较小，对人体的危害并不是非常的大。但是如果发生在腹腔内的淋巴囊肿，会对周围组织有压迫的症状，而且和周围组织粘连也比较大，所以对人体的危害也是非常明显的。
甲状腺囊肿只发生在甲状腺的部位，是由于甲状腺结节出现囊内的出血或者是甲状腺结节分泌的液体比较多，所形成的甲状腺的囊肿。表现为甲状腺的肿大，并没有明显的触痛，皮肤的表面的张力比较高。