对于非疫区且没有流行病学史的普通大众，核酸检测阴性时提示人体并没有感染新冠肺炎病毒。
但对于有流行病学史的人群，如疫区旅居史或新冠肺炎确诊患者密切接触史的人群，一次核酸检测阴性时并不能完全排除新冠肺炎，需间隔24小时以上再一次性核酸检测，两次核酸检测均为阴性时才能解除集中隔离。
而对于新冠肺炎确诊患者治疗后，也应至少两次核酸检测阴性时才可以被认定没有传染性。因此对于不同的人群，核酸检测阴性代表的意义也是不一样的。