多囊肾的患者可以出现肾结石的并发症，但并不是每一个多囊肾的人，一定会出现肾结石，一般结石的成分主要是草酸钙结石。
多囊肾出现肾结石的原因并不是非常清楚，合并有肾结石的患者特别容易出现剧烈的腰痛、肾绞痛和肉眼血尿。当然，多囊肾不仅会出现肾结石的并发症，也容易出现尿路感染的并发症，比如患者经常反复出现排尿不适的症状，甚至会出现发烧。
由于多囊肾的患者囊肿体积逐渐增大，会压迫肾脏实质，可以逐渐出现血压升高。一般是轻中度的血压升高，对于出现的高血压要积极治疗，否则长期高血压也会导致肾脏功能恶化。