乳腺癌常用的化疗方法有很多种，根据乳腺癌的分子分型不同、术后复发风险不同，以及临床分期不同，选用的化疗方案也会有所不同。
目前采用最多的化疗方案，主要有蒽环类药物联合环磷酰胺序贯紫杉类药物，蒽环类药物联合紫杉类药物，以及蒽环类、环磷酰胺联合紫杉类的三药联合方案。对于术后复发转移的患者，还可以采取长春瑞滨或吉西他滨联合铂类的药物。
根据乳腺癌的分子分型不同，可能在化疗的同时或化疗后，还需要进行其他的辅助治疗，例如Her-2阳性的患者，还需要进行靶向治疗。激素受体阳性的患者，可以辅助一定的内分泌治疗，都能够在一定程度上降低术后复发几率。