针对铜绿假单胞菌感染的治疗，临床上最常采用的抗菌药物主要是广谱半合成青霉素，如哌拉西林、美洛西林舒巴坦钠、阿洛西林等。
其中哌拉西林是目前临床上应用最广泛的抗感染药物；也可采用喹诺酮类药物治疗，如环丙沙星、氟罗沙星、氧氟沙星等都有一定的效果；第三代头孢菌素也可用于治疗铜绿假单胞菌感染，效果最好的是头孢哌酮以及头孢他啶；氨基糖苷类的药物主要有阿米卡星、异帕米星、妥布霉素以及庆大霉素等。
在使用抗菌药物治疗的同时应该给予患者平喘化痰等对症支持治疗，如细辛脑注射液、多索茶碱注射液等。
铜绿假单胞菌感染的治疗应根据患者的个人情况、感染程度以及感染部位，选取敏感的药物进行联合治疗。