目前没有发现女性吸烟跟卵巢囊肿有直接的关联，所以吸烟可能并不会导致卵巢囊肿的发生，而且卵巢囊肿的类型比较多，不同的卵巢囊肿，引起的诱因会有很大的差异。
比如女性的卵巢囊肿，可能是由于慢性盆腔炎刺激而导致，这时往往都会因为炎症的影响，而导致囊肿快速的长大，但是在炎症控制以后，囊肿又会自然萎缩变小。
还有的囊肿可能是由于卵子在排出以后，卵泡液淤积在卵泡囊内，而形成的生理性黄体囊肿，同时有极少部分的女性，可能是子宫内膜异位到卵巢上，引起的卵巢巧克力囊肿，这些囊肿跟吸烟都没有直接的关系。