对于扁桃体周围脓肿的治疗，如果脓肿尚未形成，就要按照急性扁桃体炎来对症治疗，主要是选择敏感的抗生素或者添加使用一些糖皮质激素类的药物对症治疗。
当扁桃体周围脓肿形成后，可以采用穿刺抽脓的方式来治疗。在脓肿最隆起处刺入，进针不可太深，以免损伤咽旁间隙的大血管。如果穿刺抽脓不能明显的缓解症状，就要在隆起处采用刀片切开排脓，第二天可以用血管钳来撑开排出脓液。
当扁桃体周围脓肿治愈后，一般在消炎2周后，可以考虑切除病变的扁桃体。