十二指肠乳头肿大通常都是因为疾病的因素引起的，比较常见的是因为局部的炎症引起的临床症状，例如十二指肠球炎。但也有可能是因为肿瘤等引起的，例如十二指肠乳头的息肉、恶性肿瘤、腺瘤等。
如果发生了表面的糜烂时，一般需要做病理检查，排除是否存在恶性的病变。对于炎症引起的十二指肠乳头肿大，主要是采取联合治疗，除了使用保护黏膜的药物以外，一般还需要配合促胃肠动力的药物，以及质子泵抑制剂。
对于肿瘤引起的，一般需要采取手术治疗。良性的肿瘤，比如内镜下能够切除的息肉等，可以在内镜下治疗。如果是恶性肿瘤或者内镜下无法切除的腺瘤等，需要进行外科手术治疗。