微创手术治疗痔疮，也有一定的缺点。
如果是属于环形内痔或者外痔，适合做微创手术，手术没有切口，创伤小，恢复较快，对于治疗外痔效果是较好的。但是如果痔疮并存有肛周严重感染的，在做了微创手术后容易引起复发。对于症状较轻的痔疮，可行黏膜下硬化剂注射，这种方法可以使痔疮出现萎缩，从而达到治疗，但是术后也容易复发。对于症状不严重的1期、2期便血痔疮，可采用自动套扎术，但是这种手术不能治疗外痔，而且要术后进行结扎，会出现肛门坠胀不舒服。
因此，做微创手术治疗痔疮也有缺点，选择哪种手术，需医生来决定。