真性红细胞增多症具体的发病原因并不是特别明确，如果是家族当中有真性红细胞增多症的患者，其他家庭成员有可能会出现真性红细胞增多症的几率增大。
另外，真性红细胞增多症有可能发生于长期接触X射线、伽马射线，或者是经常接触一些染发剂、杀虫剂、油漆、沥青等情况下，这些因素都有可能会诱发染色体发生畸变，从而有可能会导致红细胞的异常增殖，出现真性红细胞增多症。
如果是免疫力非常低下，经常发生病毒感染，也有可能会导致染色体发生畸变，导致真性红细胞增多症的发生。