牙龈萎缩的原因中最常见的就是由于年龄的增长出现牙周的生理性萎缩，这种就是属于老年性牙龈萎缩。
除此之外，很多患者的牙龈萎缩都是由于牙龈和牙周组织经常受到损伤刺激而导致，比如说患者有不良的刷牙习惯，喜欢用刷毛较硬的牙刷习惯横着刷牙，经常用比较锋利的牙签剔牙等，这些不良习惯就会造成牙龈经常是一种被刺激的状态，时间长了就容易导致牙龈的萎缩。
此外，患有牙周炎的患者就很容易出现牙龈萎缩，这种属于炎症消退后的牙龈组织萎缩，也被称为萎缩性牙周炎。