菊花脑可能出现的副作用是腹泻的症状。饮食不当或者吃多了会引起肠胃道方面的不适症状。其副作用一般没有什么，但需要注意一些相关的禁忌人群。
像阳虚体质者、脾胃虚寒者不建议吃菊花脑，可能会导致症状加重。所以患者在食用菊花脑时需要明确自己是什么体质，如有不明确可以咨询专业的医生。
还需要注意在吃菊花脑时的饮食禁忌，菊花脑不能够和胡萝卜、柿子以及芥末一起吃。这类食物会破坏原有的营养价值，不利于身体吸收，而且可能会出现消化不良的情况发生。