引起肛门坠胀的原因很多，肛门坠胀两年，说明引起肛门坠胀的疾病，不是急性病如肛周脓肿等。根据引起肛门坠胀的具体疾病，进行相应治疗。
如果是肛窦炎或内痔脱出引起的肛门坠胀，可外用痔疮膏，用痔疮栓纳肛，可进行肛门熏洗、坐浴。肛门炎症消退，内痔能还纳肛门内，肛门坠胀会消失。
如果肛门坠胀是由于直肠腔内肿瘤长大发生梗阻，以及向直肠周围组织浸润引起，直肠肿瘤要及时进行手术治疗。
如果肛门坠胀是由于女性盆底松弛、痉挛，以及盆底器官下垂引起，治疗上可采用局部理疗、生物反馈等治疗方法。