舌头溃疡如果有局部刺激因素，例如残根、残冠或者尖锐的牙尖造成溃疡，可以先去除这些局部因素，再针对溃疡表面进行涂抹药物治疗。用药可以选择复方呋喃西林糊剂或者是华素片，冰硼散、地塞米松等药物贴膜或者是溃疡含片，也可以采用溃疡贴。
另外，可以使用口腔炎喷雾剂、开喉剑喷雾剂或者是西瓜霜喷雾剂等，局部可以使用重组人表皮生长因素凝胶或者是外用溶液，也可以使用止痛药物，2%的利多卡因或者是达克罗宁。
对于口腔溃疡可以针对性的给予抗机体抵抗力的药物，例如胸腺肽、匹多莫德、转移因子等。一般需要口服或者注射，一般口服需要一个月为一个周期。