男性阴茎旁边长痘痘最常见的原因是阴茎旁边的毛囊炎。
因为男性阴茎根部毛囊发达，对于一些进入青春发育期以后或者成年以后的年轻男性，皮脂腺分泌旺盛。如果局部皮脂分泌以后，由于毛孔不通畅，容易滋生细菌生长，从而诱发毛囊炎症。这种毛囊炎症刚开始表现为局部小痘痘样表现，如果病情进展可能会出现红肿、疼痛，并且有化脓表现，局部还可以挤出豆腐渣样的脓血性液体。一旦脓血性液体排出以后，症状会明显好转，红肿、疼痛也会逐渐消退。
阴茎根部的小痘痘也要警惕是否是性传播疾病的可能，比如尖锐湿疣等。